(一)治疗
眼内囊尾蚴一旦确诊应尽快手术取出囊体，对合并有肠绦虫及全身囊尾蚴者，同时给予内科药物驱虫治疗。
1.手术治疗 过去眼内囊尾蚴取出沿用的方法是经巩膜定位后局部冷凝、热凝或光凝，切开巩膜脉络膜夹取或吸引取出虫体。此法由于定位的准确度不高，且虫体会自行游走常给手术带来了一定的困难。无论囊体在视网膜下或玻璃体内，取出的成功率都不高，反而还会造成严重的组织创伤。20世纪80年代玻璃体手术开展以后，运用玻璃体手术既可以完整地取出囊体，减少因囊尾蚴破裂所导致的特异性蛋白反应，又可以切除病变的玻璃体，恢复屈光间质的透明，减少牵引性视网膜脱离的发生。闭合式三切口玻璃体切割手术适用于玻璃体、视网膜内及视网膜下囊尾蚴的取出。对玻璃体囊尾蚴，手术切除混浊变性的玻璃体，游离出囊体，然后吸出。视网膜下囊尾蚴可在寄生部位切开视网膜，游离出囊体，然后吸出，同时作视网膜光凝封闭视网膜裂孔。若合并有牵引性视网膜脱离，可同时切除牵引灶，激光或冷冻封闭裂孔，必要时作气体或硅油填充。
前房内囊尾蚴较为少见，其葡萄膜反应较重，常出现急性虹膜睫状体炎，可适当应用激素减轻反应，同时尽快取出虫体。手术在角膜缘经隧道式切口进入前房，在囊尾蚴的下方或后方注入黏弹剂，推压或吸出虫体。结膜下囊虫可直接切开结膜取出。
2.药物驱虫治疗 对眶内囊尾蚴一般不需要手术取出，对合并有肠绦虫或全身囊尾蚴者，特别是合并有脑囊尾蚴者，要同时进行驱虫治疗。目前常用的驱虫药物首选吡喹酮(Praziqtlantel)，本品为广谱驱虫药物，不仅对绦虫有较高的疗效，对囊尾蚴也有很高的杀灭作用。驱绦虫一般剂量为15～25mg/kg(儿童15mg/kg)，一次口服。对囊尾蚴的治疗一般取总量120mg/kg，3～4天内分次口服。对脑囊尾蚴无明显颅内压增高时，总量可用到180mg/kg，20mg/(kg·d)，3～4天内服完。其他常用药物还有阿苯哒唑(Albendazole)等，也对绦虫及囊尾蚴有较好的疗效。对脑囊虫用驱虫药治疗时常有反应性颅压增高，治疗时应予注意。
(二)预后
取决于囊尾蚴在眼内的寄生部位，存活时间及手术能否顺利取出。对寄生于眼底周边的囊尾蚴若能尽早取出一般预后良好，治愈后一般能保存较好的视功能。若寄生于黄斑部者即使手术取出也将严重影响视功能。囊尾蚴在人体组织内可存活3～5年，在眼内也可存活1.5～2年，存活的时间越长对眼的损害就越大。眼内囊尾蚴一旦死亡，虫体分解产物的毒性作用可产生强烈刺激，造成严重的葡萄膜反应。因此对死亡的囊体也应尽力取出，终止毒性反应。
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