(一)衣原体
根据许多国家报告，NGU中30%-50%，淋病病人中20%和性活动强但无尿道炎症状的人中0.5%，以目前常用的培养方法，尿道分泌物可培养出衣原体，女性病人因多数无症状或仅表现为白带增多等妇科症状，难以确定其发病率，有人估计女性病人可能为男性的4倍， 衣原体是一种寄附于腺上皮细胞胞浆内的微生物，呈球型，有特殊的生长周期，每个生长周期有两种发育型， 感染型为原体(elementary body)呈球形，大小介于细菌与病毒之间(300-400mm)，原体可在细胞外生存，有感染性，当其附着在易感细胞表面时，被细胞吞饮，在细胞内原体变成另一种繁殖型， 繁殖型即始体(initial body)始体呈圆形或椭圆形，始体按二分裂方式繁殖，最后始体重新组织成原体，从细胞内释放出来，再感染其他健康易感细胞，整个生长周期为72h， 衣原体分类：1，鹦鹉热衣原体，2，沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis) 沙眼衣原体至少有15个血清型，D-K8种血清型与NGU有关，L1，L2，L33个型与性病性淋巴肉芽肿(第四性病)有关。
(二)支原体
1，分解尿素支原体(ureaplasma ure-alyticum)是一种原核微生物，能产生尿素分解酶分解尿素，呈球杆状，因其缺乏坚硬的细胞膜，故不为青霉素所抑制，四环素，红霉素，壮观霉素对之有效，现已从人类泌尿生殖道分离出来7种支原体，其中分离率较高而与泌尿生殖道疾病有关，是分解尿素支原体，其次是人型支原体，婴儿或无性交接触的女性生殖道内找不到分解尿素支原体，而性生活越乱，这种支原体阳性率也越高，Mc Donald 1982年报告587例急性尿道炎症状病人中，209例(36%)中段尿中分离出分解尿素支原体。
2，人型支原体(mycoplasma hominis)支原体对外界环境抵抗力弱，45℃15min即可被杀死，对肥皂，酒精，四环素，红霉素敏感， 衣原体除致成尿道炎，眼结膜炎外，还可致成其他生殖器官炎症，如附睾炎，前裂腺炎，宫颈炎，阴道炎，输卵管炎及盆腔炎等，新生儿通过感染的产道可诱发眼结膜炎，肺炎，男性同性恋者，可患直肠炎及咽炎。
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